ROR1-AS1在胆管癌中的表达及生物学特性的研究

目的:研究IncRNA ROR1-AS1在胆管癌中的表达情况,并判断该基因对胆管癌进展过程中起到的作用,从而对胆管癌早期筛查提供线索,为下一步治疗提供新的技术思路,最终给病人带来更多福音。方法:首先,我们在R语言的帮助下,我们从生信数据库中查找关于胆管癌相关的基因,并根据此为基Phylogenetic analyses础,探索出ROR1-AS1在胆管癌中的表达情况及其与胆管癌患者的临床病理学特征的关系。在这之后,我们利用Timer数据库,进一步找出ROR1-AS1在胆管癌中的表达情况与免疫细胞及免疫微环境的关系。除此之外,我们又进行了 GSEA分析,查找ROR1-AS1在胆管癌中的表达通路及在通路中的富集情况。我们还进行了甲基化分析,探索ROR1-AS1甲基化在胆管癌中的表达情况。并且我们还根据此进行了 Calibration 分析。之后我们分别进行了细胞实验分析和动物实验证实了我们的研究。首先我们运用用RNA 干扰(RNA interference,RNAi)相关技术将获得的小干扰 RNA(small interfering RNA,siRNA)在脂质体的介导下转染入胆管癌QBC939,HuCCT-1,RBE三种细胞系中。分为对照组(si RNA-NC)和实验组(si RNA-ROR1-AS1),通过实施荧光定量PCR确认转染效率。利用CCK-8染色及克隆形成实验明确胆管癌增殖情况;利用Transwell迁移和划痕实验明确细胞迁移及侵袭能力。通过Graph Pad Prism 7.0软件进行统计学分析比较两组差异。结果:我们的分析表明ROR1-AS1有促进胆管癌细胞继续进展的作用。我们将ROR1-AS1 siRNA转染到胆管癌QBC939,HuCCT-1,RBE细胞系中;在三种细胞系中,用买来的三种si-RNA进行qPCR(八连排)分析,发现第一种si-RNA干扰效率GDC-0068供应商较高;在胆管癌细胞中沉默ROR1-AS1基因后,再用此种小干扰RNA进行CCK8增殖实验,我们的结论指出敲降掉ROR1-AS1基因的后胆管癌细胞的增殖速度较对照组明显降低(P<0.01);之后我们开展的克隆形成实验也发现敲掉ROR1-AS1基因的实验组中可观察到的细胞集形成数量较未敲降ROR1-AS1基因的细胞相比明显减少(P<0.05);我们之后进行的划痕实验指出,沉默掉ROR1-AS1基因的细胞迁移能力与对照组相比明显降低(P<0.01);我们随后开展的Transwell迁移和侵袭实验进一步探知实验组中能够穿过小室的细胞数与对照组中的细胞数相比数量有明显下降(P<0.01),这就可以认被敲降掉ROR1-AS1基因后的胆管癌细胞的迁移和侵袭能力明显下降。接下来我们开展的动物实验也发现敲除掉ROR1-AS1的实验组与没有敲除ROR1-AS1的对照组相比,小鼠肿瘤体积减小。此外,我们还发现ROR1-AS1的表达在CHOL患者的神经浸润(P<0.05)和表达水平(P<0.05)之间有强烈的依赖性。通过Timer数据库我们可以看出胆管癌患者中的免疫细胞与ROR1-AS1的表达可能有明显的相关性(P<0.05),其中嗜酸性粒细胞aDc细胞(激活树突状细胞)和Th1细胞(T辅助细胞1)与ROR1-AS1的表达可能有一定联系。最后,我们发现了预测了一些有CHOL中与ROR1-AS1表达相关的信号通路,这些信号通路在特征数据库中得到了最明显的富集,而且我们还做了胆管癌中与ROR1-AS1药物敏感性方面的相关研究。结https://www.selleck.cn/products/lee011.html论:细胞和动物实验充分证实了 ROR1-AS1在胆管癌细胞中的作用。ROR1-AS1可能通过某种途径促进胆管癌的进展,从而影响胆管癌的预后。此外,ROR1-AS1的表达与CHOL患者的神经浸润,TNM分期有密切关系。