铁死亡在肌少症中显著激活

背景:肌少症(sarcopenia,SP)著降低老年人群活动能力和生活质量,增加外科手术风险,给社会带来沉重的经济负担,目前发病机制不明。铁死亡作为一种铁依赖性、脂质过氧化损伤为特征的细胞死亡形式,近期研究发现与衰老、炎症等多种慢性疾病密切相关。目前,铁死亡及相关基因在SP患者骨骼肌中改变情况尚不明确。方法:从同济大学附属第十人民医院发起的一项前瞻性队列中收集患者临床信息及肌肉样本,并对SP和非肌少症(NSP)患者肌肉非血红素铁含量检测、总抗氧化能力(T-AOC)、脂质过氧化物MDA含量、线粒体形态学进行检测。同时从GEO数据库获取SP和对照组(NSP)骨骼肌RNA-seq数据,使用limma算法进行差异表达基因(|log2FC|>1,p-<0.05)分析,并从FerrDb数据库下载所有铁死亡相关基因,通过R语言Venn Diauro-genital infectionsgram获得两GSK J4 NMR者的交集基因(F-DEGs)。结果:本研究共纳入SP和性别、年龄匹配的NSP患者各12例。临床资料分析提示NSP与SP的瘦体重、CRP、白细胞、血红蛋白、血浆白蛋白水平存在显著差异。肌肉含量及功能分析提示SP组ASMI、L3-SMI、肌纤维横截面积、优势手握力、骨骼肌ATP含量及线粒体SDH酶活性较NSP显著下降,胶原纤维含量、凋亡阳性肌核占比显著增加,蛋白分解通路显著激活,透射电镜下异常线粒体数目增多。铁死亡结局指标分析提示:与NSP组相,SP骨骼肌中T-AOC(44.67±9Alisertib IC50.48mmol/g v.s. 23.77±7.32mmol/g)、非血红素铁含量(0.65±0.15mg/dl v.s. 1.25±0.25mg/dl)、MDA水平显著升高(27.10±5.18mg/gv.s.44.67±9.48mg/g),同时透射电镜发现线粒体发生染色加深、体积皱缩及数量下降等特征性改变。生信分析共纳入SP和性别、年龄匹配的NSP患者各20例,分析得到7个铁死亡相关F-DEGs,分别为SLC38A1、ATP5MC3、SCD、NOX1、DUOX1、ALOXE3以及ALOX12B,进一步验证发现仅有NOX1表达量在SP组骨骼肌中显著上调。结论:SP患者骨骼肌含量、力量及线粒体功能显著下降,同时伴有铁死亡激活。铁死亡通路相关分子中,NOX1在SP组表达量显著升高。

不同浓度萝芙木提取物对良性前列腺增生大鼠细胞增殖的影响

目的:探讨不同浓度的萝芙木提取物(RE)对BPH模型大鼠前列腺组织中细胞增殖的影响。方法:SD大鼠去势后,皮下注射丙酸睾酮[5mg/(kg·d)]构建BPH模型,将BPH大鼠随机分为BPH模型组、非那雄胺组、RE低浓度组、RE中浓度组、RE高浓度组,未造模的SD大鼠为正常对照组。非那雄胺组大鼠按5 mg/kg体重灌胃非那雄胺溶液,RE低、中、高浓度组分别按照浓度为5、10、20 mg/kg体重灌胃RE溶液,对照组和BPH模型组灌胃等剂量生理盐水,1次/d,连续28 d。实验结束处死大鼠,取前列腺组织,称量前列腺湿重,容积法检测前列腺体积,计数前列腺指数,检测血清中睾酮和双氢睾酮含量,HE染色plant bacterial microbiome观察前列腺组织结构变化,结合图像分析系统,半定量检测前列腺组织腺体数目、腺体管腔面积,并采用免疫组化检测增殖细胞核抗原PCNA和α-SMA阳性表达率。结果:与对Liraglutide照组相比较,BPH模型组的前列腺湿重、前列腺体积和前列腺指数均显著升高[(1.455±0.52) g vs(0.923±0.15) g,(1.687±0.31) ml vs(1.035±0.29) ml,(0.37±0.15)%vs(0.23±0.04)%,P<0.05];腺体平均数目显著减少[(12.56±2.58)vs(20.35±3.83),P<0.01];上皮厚度增加约2倍[(39.76±5.20)μm vs(19.52±1.52)μm,P<0.01];腺体内管腔面积减少了50%左右[(5.96±0.34)×10~3μm~2vs(12.3±1.21)×10~3μm~2,P<0.01]。并且前列腺间质和血管扩张充血水肿,细胞增殖速率明显增高。RE和非那雄胺处理后均可以逆转上述结果。不同浓度RE处理后前列腺湿重显著降低、前列腺体积明显减小及前列腺重量指数显著降低,其中高浓度组效果最显著[(0.862±0.31) g vs(1.455±0.52) g,(0.952±0.28) ml vs(1.687±0.31) ml,(0.22±0.07)%vs(0.37±0.15)%,P<0.05]。不同浓度RE处理后前列腺组织病理学改变改善明显,腺体数目、上皮厚度和腺体内面积显著回归,RE高浓度组效果最为明显[(18.36±1.25)vs(1INCB018424采购2.56±2.58),(19.04±3.89)μm vs(39.76±5.20)μm,(10.25±0.98)×10~3μm~2vs(5.96±0.34)×10~3μm~2,P<0.05]。同时,RE显著抑制PCNA和α-SMA蛋白表达,并显著降低BPH大鼠血清中双氢睾酮和睾酮含量,RE高浓度组效果最显著[(2.532±0.386) ng/ml vs(9.052±0.633) ng/ml,(6.016±1.978) ng/ml vs(19.147±3.214) ng/ml,P<0.05]。结论:RE能够呈浓度依赖式抑制BPH大鼠前列腺细胞增殖,缓解BPH症状。

禾谷镰孢半胱天冬氨酸酶FgCas4的生物学功能

半胱天冬氨酸酶(caspase)在哺乳动物中参与调控细胞凋亡过程,控制着多种疾病的发生发展。本研究利用基因敲除和回补的方法,获得了禾谷镰孢中半胱天冬氨酸酶基因FgCas4的敲除突变体ΔFg Cas4和回补体ΔFg Cas4-C。通过观察分析发现,基因FgCas4的缺失并不影响禾谷镰孢的生长速率、菌落形态、分生孢子产量、致病和产毒。但是,敲除突变体ΔFgCas4的菌丝分支变多且具有3个selleck抑制剂隔膜的分生孢子比例较野生型和回structured biomaterials补体增加了8.7%。对外界环境胁迫因子耐受性测定显示,ΔFgCas4对杀菌剂和金属离子的敏感性显著增加,同时其细胞内脂滴含量增多,对渗透胁迫因子抗性变强。亚细胞定位发现,半胱天冬氨酸酶FgCas4定位于液泡中。此外,基因FgCas4的缺失导致禾谷PLX5622 MW镰孢细胞自噬过程明显提前。上述研究结果表明,禾谷镰孢中半胱天冬氨酸酶FgCas4主要在菌体无性繁殖、对不同环境胁迫的应答以及细胞自噬过程中发挥重要作用。

基于细胞焦亡和铁死亡的肝细胞癌分子分型生物信息学研究

肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)是一种高异质性、高发病率和高死亡率的恶性肿瘤,基于HCC相关的分子特征建立分子分型方法,对改善患者预后具有重要意义。细胞焦亡和铁死亡作为两种新近发现的调节性细胞死亡方式,与HCC的发生、发展和治疗都密切相关,具有用于HCC分子分型的潜力。本文通过对大型肿瘤基因组数据库进行生物信息学分析,探究细胞焦亡和铁死亡用于HCC分子分型的潜力。具体如下:1、基于细胞焦亡的肝细胞癌分子分型生物信息学研究(1)基于与HCC相关的细胞焦亡基因的表达,我们将HCC患者分成了两个具有显著异质性的细胞焦亡分子亚型,Py High和Py Low,Py High亚型具有更高的细胞焦亡表达。(2)单因素和多因素Cox分析表明我们所建立的细胞焦亡分子分型方法是HCC的潜在独立预后指标,Py High亚型可能预示着患者的更差预后(单因素Cox:HR=1.668,P=0.011;多因素Cox:HR=1.633,P=0.02Taxus media0)。分层生存分析结果显示,该细胞焦亡分子分型方法还可用于TNM(III+IV)期和MYC非扩增型亚群患者的预后预测(Log-rank检验,P<0.01)。(3)基于癌症药物敏感性基因组学数据库的数据,我们为Py Low亚型和Py High亚型分别预测到了5个和31个不同的敏感化合物,其中分别有2个和13个已被文献报道有抗HCC活性,其中又有三个上市药物已有HCC相关临床实验,包括吉非替尼、吉西他滨和福瑞替尼(前者对Py Low亚型敏感,后两个对Py High亚型敏感),表明该分子分型方法有望助力HCC的敏感化合物合理选择。(4)机制分析表明细胞焦亡亚型在HCC中的预后和化合物敏感性异质性可能与肿瘤免疫,特别是细胞因子相关。Py High亚型具有更丰富的淋巴细胞浸润和更高水平的细胞因子相关基因表达。2、基于铁死亡的肝细胞癌分子分型生物信息学研究(1)基于结合前馈神经网络和Cox比例风险模型的深度神经网络模型所提取的与HCC预后相关的铁死亡特征,我们将HCC患者分成了两个具有显著异质性的铁死亡分子亚型,Fe High和Fe Low。Fe High亚型患者具有更高的铁代谢、ROS代谢和脂质代谢相关通路活性。(2)单因素和多因素Cox分析表明我们所建立的铁死亡分子分型方法是HCC具有潜力的独立预后指标,Fe Low亚型患者的预后可能更差(单因素Cox:HR=3.784,P<0.001;多因素Cox:HR=3.816,P<0.001)。分层生存分析结果显示,该铁死亡分子分型方法的预后预测能力具有广泛的人群适用范围。在TNM(I+II)期、TNM(III+IV)期、TP53野生型、TP53突变型、MYC非扩增型和MYC扩增型特定亚群患者中,它依旧能较好地区分高低风险人群(Log-rank检验,除MYC扩增型P=0.007外,其它均P<0.001)。(3)化合物敏感性分析显示两个铁死亡亚型的化合物敏感谱也具有异质性,Fe High亚型和Fe Low亚型分别被预测到了13个和Naporafenib使用方法7个不同的敏感化合物,其中分别有4个和3个已被文献报道具有抗HCC活性,其中吉非替尼(对Fe High亚型敏感)已有HCC相关临床实selleck抑制剂验,这提示该分子分型方法对HCC的化合物敏感性也具有一定预测价值。有趣的是,我们还发现Fe High亚型与Py Low亚型的化合物敏感谱相似,Fe Low亚型与Py High亚型的化合物敏感谱相似,表明铁死亡分子分型和细胞焦亡分子分型可潜在联合用于HCC的化合物敏感性预测。(4)机制分析表明铁死亡分子分型影响HCC的预后和化合物敏感性异质性可能与细胞色素P450代谢、细胞外基质-受体相互作用等通路相关。综上所述,本文基于细胞焦亡和铁死亡相关功能基因,初步建立了两种具有潜在临床应用价值的新型HCC分子分型方法。首先,它们均可用于HCC的预后预测,其中铁死亡分子分型方法具有广泛的人群适用范围,有望助力临床工作者对患者进行风险分层管理。其次,这两种方法可联合用于HCC的敏感化合物预测,进而可能筛选到更可靠的敏感化合物,为制定个性化用药方案提供潜在参考。

雷珠单抗联合全视网膜激光光凝术治疗重度非增生型糖尿病视网膜病变患者的效果

目的:观察雷珠单抗联合全视网膜激光光凝术(PRP)治疗重度非增生型糖尿病视网膜病变(NPDR)患者的效果。方法:选取2020年1月至2021年12月该院收治的86例(86眼)重度NPDR患者进行前瞻性研Liproxstatin-1说明书究,按随机数字表法将其分为对照组和观察组各43例。对照组采用PRP治疗,观察组采用玻璃体腔注射雷珠单抗联合PRP治疗。比较两组PRP术中激光功率、能量密度、光斑数、治疗前后视功能[最佳矫正视力(BCVA)、黄斑中心凹厚度(CMT)]、眼底新生血管指标[血管内皮生长因子(VEGF)、深层毛细血管丛(DCP)血流密度]及并发症发生率。结果:观察组PRP术中激光功率、能量密度均低于对照组,光斑数少于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);治疗后,观察组BCVA、DCP血流密度高于对照组,VEGF水平低于对照组,CMT小于对照组,差异均有统计学Diasporic medical tourism意义(P<0selleck合成.05);两组并发症发生率比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:雷珠单抗联合PRP治疗重度NPDR患者有利于降低血清VEGF水平,减小PRP手术难度,增加DCP血流密度,改善视功能,效果优于单用PRP。

基于全集成基因芯片检测系统的运动代谢基因自动化检测

研究目的:已有研究表明,运动后血液同型半胱氨酸(Homocysteine,Hcy)水平升高,急性剧烈运动后Hcy升高更显著,经常训练的运动员群体血液中的Hcy水平显著超出正常水平,被称为运动导致的高同型半胱氨酸血症(hyperhomocysteinemia,HHcy)。血液Hcy过高会引起血管内皮细胞损伤和功能障碍,是导致血管粥样硬化、脑卒中等心血管疾病的独立危险因素。维生素B9(叶酸)能够降低血液中同型半胱氨酸(Homocysteine,Hcy)水平,减少血管炎症和卒中风险。人体自身无法合成叶酸,只能从食物中获取。已知基因型是影响叶酸吸收和Hcy降低的重要影响因素。MTHFR C677T、MTHFR A1298C、MTRRA66G是最常见的三个单核苷酸多态性(SNP)位点,影响叶酸代谢酶的活性,进而影响血液中Hcy的降低。在我国汉族人群中,上述基因突变率显著高于西方人。因此,我国运动人群中应有更多人存在运动相关HHcy风险,危害他们的心脑血管健康。针对现在核酸检测普遍操作繁琐、需要专业实验室和专业操作人员的缺点,本研究利用全基成的微流控基因芯片技术,建立了无创伤、全自动、免人工操作、不需要专业人员的叶酸代谢基因型检测技术和系统,能够安装在体育场馆、学校、甚至运动现场附近,使运动人员能够方便、快速、准确地把握自身的叶酸代谢能力,进而开展精准的运动营养补充,防范运动相关HHcy风险和心血管疾病风险。研究方法:基于无创伤、全自动、免人工操作的基因检测系统,来实现叶酸代谢基因型的检测。主要技术内容包括:环介导的核酸恒温扩增(LAMP,Loop-mediated isothermal Amplification)技术,核酸扩增的可视化检测技术,全集成的微流控基因芯片技术。本基因检测系统由核酸提取模块、扩增模块和检测分析仪组成。核酸提取模块中样本细胞被裂Bafilomycin A1小鼠解,DNA被捕获并通过硅胶膜洗脱。在核酸扩增模块捕获的DNA与LAMP试剂进行混合,后注入检测芯片进行扩增反应。分析仪实现检测结果的自动判断,由三个模块组成:气路模块、加热模块和光学扫描模块。系统完全自动化操作,实现了”样本输入-应答-输出”的检测模式。目标基因序列由美国国家生物技术信息中心(NCBI)获得,使用SnpGene软件针对MTHFR C677T、MTHFR A1298C、MTRRA66G位点设计LAMP引物,引物由生工生物(上海,中国)合成。采用口腔拭子获取检测样本。利用环介导等温扩增(LAMP)技术检测多个基因位点,等温扩增检测反应程序为恒温65℃,45min。利用染料实现核酸扩增检测结果的可视化,反应室的颜色表示是否存在基因扩增,如果存在基因扩增,阳性反应后试剂的颜色从紫色变为绿色。通过对比反应前后试剂颜色进行SNP位点的判断。每个SNP位点需要两个反应腔进行检测,分别检测突变型和野生型,若两检测腔颜色都变为绿色,则说明该基因型为杂合子。使用PCR加一代测序技术作为金标方法开展对比测试,验证本系统的检测准确性。PCR检测体系为:缓冲液、引物、热启动酶(Hot start enzyme)、DNA模板和无核酸水。反应程序为:95℃进行5min,94℃进行30s,60℃进行30s,72℃进行1min。PCR产物测序由生工生物(上海,中国)完成。测序结果使用BioEdit软件进行分析。在体育高校招募受试者,要求具有一定的运动等级或经常进行体育活动,存在运动致HHcy的风险。采集受试者口腔拭子样本,使用建立的全自动基因检测系统进行MTHFR C677T、MTHFR A1298C、MTRRA66G基因位点基因检测。统计基因型分布以及各基因突变率,分析潜在HHFc-mediated protective effectscy风险。研究结果:通过与基因测序结果对比,本研究搭建的全自动基因检测系统的灵敏度和特异性表现良好,并且基因芯片室间无交叉污染,SNP位点的分型检测的灵敏度达到300 copies/μl。完成26名运动人员的MTHFR MTRR全自动基因检测。26人成功检出,结果与基因测序结果一致。MTHFR C677T基因CC野生型4人,CT杂合型10人,TT突变型12人,C等位基因的频率为0.364,T等位基因的频率为0.654;MTHFR A1298C基因AA野生型21人,AC杂合型1人,CC突变型4人,A等位基因的频率为0.827,C等位基因的频率为0.173;MTRR A66G基因AA野生型24人,AG杂合型2人,无GG突变型,A等位基因的频率为0.962,G等位基因的频率为0.038。风险基因型MTHFR C677T位点TT型12人,MTHFR A1298C位点CC型4人,MTRR A66G位点AG型2人,只有一人同时有TT与AG基因型,其他个体均为单一位点突变风险。研究结论:利用全集成微流控基因芯片技术和可视化核酸简易检测技术,首次成功建立了对MTHFR、MTRR基因位点SNP的全自动基因检测体系,特异性好、灵敏Ferrostatin-1体内实验剂量度高。受试者基因突变率:MTHFR C677T>MTHFR A1298C>MTRR A66G。17名运动人员存在风险基因型,因此存在运动相关的HHcy风险以及心血管健康风险。上述人群的基因型特征表明,普通饮食已经无法满足需求,应在运动前服用叶酸补剂,来避免运动导致的血液中Hcy水平过高。本研究研发的叶酸代谢基因型全自动检测系统,实现了运动人员叶酸补充的精准化和个体化,在个性化精准运动营养领域,实现技术创新。

苓桂术甘汤对心梗后慢性心衰模型大鼠心肌纤维化及心肌组织Wnt1/β-catenin信号通路蛋白表达的影响

目的:观察苓桂术甘汤对心肌梗死后慢性心衰大鼠心肌纤维化及心肌组织Wnt/β-catenin通路相关分子表达的影响,探讨点击此处其抑制心肌纤维化的作用和可能机制。方法:采用冠脉左前降支结扎法复制心肌梗死后慢性心衰大鼠模型;造模24 h后,连续干预4 w。采用小动物彩色Tumor biomarker多普勒超声成像系统检测大鼠LVIDd、LVIDs、LVEF、LVFS;HE及Masson染色观察大鼠心肌组织病理学变化;ELISA法检测大鼠血清CK-MB、cTnT及心肌组织CollagenⅠ、CollagenⅢ水平;Western Blot检测大鼠心肌组织Wnt1、GSK-3β、p-GSK-3β、β-catenin、α-SMA及细胞核β-catenin蛋白表达;RT-qPCR检测大鼠心肌组织β-catenin、MMP-9 mRNA表达。结果:与假手术组比较,模型组大鼠LVIDd、LVIDs水平显著升高,LVEF、LVFS水平显著降低(P<0.01),心肌组织出现明显的心肌细胞排列紊乱,心肌纤维部分断裂及间质纤维化等病理变化,血Z-IETD-FMK体内清CK-MB、cTnT和心肌组织CollagenⅠ、CollagenⅢ含量及CollagenⅠ/CollagenⅢ比值显著升高,心肌组织细胞质GSK-3β蛋白表达显著降低,心肌组织α-SMA蛋白及细胞质Wnt1、β-catenin、pGSK-3β蛋白和细胞核β-catenin表达显著升高,心肌组织β-catenin、MMP-9 mRNA表达显著升高(P<0.01)。与模型组比较,苓桂术甘汤干预4 w后,上述指标均显著改善(P<0.05或P<0.01)。结论:苓桂术甘汤能减轻心肌梗死后慢性心衰大鼠心肌损伤并抑制心肌纤维化,改善CHF大鼠心功能,此作用与其抑制心肌组织Wnt/β-catenin信号通路激活有关。

健脾清化化瘀汤对幽门螺杆菌相关胃癌前病变大鼠胃黏膜miR-21、PTEN表达的影响

目的 探讨健脾清化化瘀汤治疗胃癌前病变的可能作用机制。方法 将90只健康清洁级雄性SD大鼠按照随机数字表法随机分为6组,包括正常组、模型组、诱导型一氧化氮合酶(inducible nitric oxide synthase, iNOS)抑制剂组、健脾清化化瘀汤低剂量组、健脾清化化瘀汤中剂量组、健脾清化化瘀汤高剂量组。除正常组外,其Ipatasertib临床试验余5组大鼠均用1×10~(9 )CFU/mL幽门螺杆菌(helicobacter pylori, HP)菌液灌胃7次,平均2次/周。确认HP感染后,除正常组外,其余5组均予150μg/mL甲基-N-硝基-N亚硝基胍(MNNG)溶液灌胃,频率5次/周,同时予100μg/mL MNNG溶液自由饮用,配合0.03%雷尼替丁饲料喂养、饥饱失常法(2天足量饲料喂养,1天禁食),持续造模28周。造模成功后,健脾清化化瘀汤低、中、高剂量组分别给予相应剂量健脾清化化瘀汤灌胃,iNOS抑制剂组给予氨基胍溶液50 mg/(kg·d)剂量进行灌胃,SAG分子量正常组及模型组予以生理盐水进行灌胃,均1次/天,干预治疗10周。干预结束后,运用苏木精—伊红染色观察大鼠胃黏膜病理变化;运用免疫组化法检测胃组织磷酸酯酶与张力蛋白同源物(phosphate and tension homology deleted on chromosome ten, PTEN)蛋白表达;运用RT-PCR法检测胃组织miR-21、PTEN mRNA表达。结果 与正常组比较,模型组大鼠胃黏膜可见腺体萎缩、肠化、异型增生,健脾清化化瘀汤中、高剂量组及iNOS抑制剂组较模型组有不同程度的改善,健脾清化化瘀汤低剂量组改善不明显。各ventral intermediate nucleus组大鼠胃黏膜miR-21、PTEN mRNA、PTEN蛋白表达差异均有统计学意义(P<0.01)。与空白组比较,模型组miR-21表达显著升高(P<0.01),PTEN mRNA、蛋白表达显著下调(P<0.01;P<0.01);与模型组比较,健脾清化化瘀汤中、高剂量组、iNOS抑制剂组miR-21表达下调(均P<0.01),PTEN mRNA、蛋白表达升高(P<0.05;P<0.01),健脾清化化瘀汤低剂量组miR-21、PTEN mRNA、蛋白表达较模型组差异均无统计学意义。结论 健脾清化化瘀汤可能通过下调胃黏膜miR-21的表达,解除miR-21对PTEN表达的抑制,进一步激活PTEN下游信号通路,从而缓解胃黏膜病变,阻断胃癌前病变向胃癌进展。

基于Src/PI3K/Akt信号通路研究草乌甲素抑制类风湿关节炎骨破坏的作用机制

基于非受体酪氨酸激酶(sarcoma receptor coactivator,Src)/磷脂酰肌醇-3-激酶(phosphatidylinositol-3-kinase,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,Akt)信号通路探索草乌甲素改FG-4592善实验性类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)骨破坏的作用机制。通过GeneCards、PharmGKB和OMIM数据库收集RA骨破坏的关键靶点,利用SwissTargetPrediction和PharmMapper数据库收集草乌甲素的潜在靶点,借助Venny 2.1.0平台获得交集靶点,运用STRING数据库及Cytoscape 3.8.0进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络构建及拓扑分析。在DAVID数据库进行基因功能注释(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,运用AutoDock Vina对草乌甲素与关键靶点进行分子对接和结合能力预测。最后建立NF-κB配体受体激活物(receptor activator of nuclear factor-κB,RANKL)诱导体外破骨细胞分化模型,采用定量实时聚合酶连锁反应法(quantitative real time polymerase chain reaction,qRT-PCR)检测相关靶点mRNA表达水平,免疫荧光法、蛋dental pathology白免疫印迹法检测关键靶点蛋白表达水平。结果发现,药物-疾病靶点共29个,Src为草乌甲素抗RA骨破坏的核心EPZ-6438靶点。KEGG富集分析发现草乌甲素可能通过调控Src/PI3K/Akt信号通路发挥抗RA骨破坏的作用。分子对接结果显示,草乌甲素与Src、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶(phosphatidylinositol-4,5-diphosphate 3-kinase,PIK3CA)和AKT1均有较好的结合能力。实验验证结果显示,草乌甲素不仅剂量依赖性地抑制破骨细胞分化相关基因组织蛋白酶K(cathepsin K,CTSK)、基质金属蛋白酶-9(matrix metalloproteinase-9,MMP-9)mRNA的表达(P<0.01),还显著降低体外破骨细胞中p-c-Src、PI3K及p-Akt的表达(P<0.01)。综上,草乌甲素可能通过调控Src/PI3K/Akt信号通路抑制RA骨破坏。该研究为草乌甲素改善RA骨破坏提供实验支撑,也将为草乌甲素的临床应用奠定基础。

铁死亡相关基因DPP4与肿瘤免疫及预后的生物信息学研究

目的:分析铁死亡相关基因DPP4在泛癌中selleck化学的表达及其在肿瘤免疫、预后等方面的作用,探讨DPP4在肿瘤免疫治疗及临床预后中的价值。方法:利用CCLE、TCGA及GTEx数据库对铁死亡相关基因DPP4进行泛癌的差异表达分析,并通过Kaplan-Meier及Cox回归分析DPP4与肿瘤预后的相关性;使用CIBERSORT算法评估TIMER数据库中肿瘤免疫细胞浸润情况,ESTIMATE算法评估肿瘤微环境,Spearman检验分析基因表达与免疫新抗原、肿瘤突变负荷及微卫星不稳定性的关联;GSEA软件研究DPP4在肿瘤中的表达与信号通路的相关性。结合人类蛋白质图谱数据库、TCGA数据库及GEO数据库对分析结果进行验证。结果:DPP4基因在多种肿瘤中的表达差异具有统计学意义,且与多种肿瘤的生存及预后密切相关,其中在嗜铬细胞瘤和副神经节瘤(PCPG)、胸腺癌(THYM)中可作为保护因素,对肿瘤预后有正向作用;DPP4与肿瘤的多种免疫细胞浸润及免疫微环境密切相关,最显著相关的3类肿瘤为膀胱尿路上皮癌(BLCA)、乳腺浸润癌(BRCA)、嗜铬细胞瘤和副神经节瘤(PABT-199小鼠CPG);DPPRodent bioassays4与免疫新抗原、肿瘤突变负荷与微卫星不稳定性显著相关;GSEA分析结果显示存在多个与DPP4在肿瘤中高低表达相关的生物学通路,主要集中于物质代谢及炎症反应等通路;人类蛋白质图谱和TCGA、GEO数据库证实DPP4在肺癌、乳腺癌、直肠癌和前列腺癌中表达存在差异。结论:铁死亡相关基因DPP4可作为肿瘤免疫治疗的生物靶点用于泛癌预后评估,对临床肿瘤诊断、治疗及预后具有重要意义。