目的:筛选甲状腺癌(TC)差异预后铁死亡基因(PFRGs),构建TC铁死亡相关基因(FRGs)预后风险模型,并阐述其潜在作用机制。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取基因表达及临床数据,从铁死亡疾病数据库(FerrDb)和人类基因数据库(GeneCards)中获取FRGs,采用R软件筛选TCPFRGs;从TCGA和GTEx数据库获取TC组织和甲状腺组织中PFRGs mRNA表达数据,从人类蛋白图谱(HPA)数据库获取免疫组织化学结果,验证PFRGs mRNA和蛋白表达的差异;采用时间依赖性受试者工作特征(time-ROC)曲线和Kaplan-Meier曲线评估PFRGs与TC患者生存和预后的关系;采用单因素和多因素Cox回归分析计算https://www.selleck.cn/products/torin-1.htmlPFRGs表达的风险评分,纳入TC患者临床数据,进行独立预后分析,并构建Nomogram图;TCGA数据库中PFRGs与各基因表达的相关性采用Spearman相关分析,计算相关系数并筛选共表达基因;采用生物信息学方法对PFRGs共表达基因进行蛋白-蛋白互作(PPI)网络图、基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:在TC中差异分析筛选出3 317个上调基因和3 456个下Genetic hybridization调基因,单因素Cox回归分析筛选出343个差异表达基因(DEGs)与TC患者的生存和预后相关,其中包括CD44、膜联蛋白A1(ANXA1)和核受体亚家族4A类成员1 (NR4A1)。Kaplan-Meier和time-ROC曲线显示CD44、ANXA1和NR4A1的表达与TC患者生存和预后有关联(P=0.048,P=0.005,P=0.036),且均具有良好的1、3和5年生存预测作用。构建3个基因风险评分系统,风险评分作为TC患者临床预后因子[风险比(HR)=8.882,95%CI:1.561~50.547,P=0.014)],风险评分越高,生存预后越差[P=0.011,ROC曲线下面积(AUC)=0.761、0.767和0.722];风险评分联合TC患者临床特征构建的Nomogram图(C-index=0.938)对TC患者的生存具有较好的预测作用。共表达与富集分析,TC铁死亡主要与其共表达基因(DUSP1、 DUSP5、 DUSP6、 FOS、 IL1RAP、 JUN、 MET、RASGRF1、TGFA、TGFBR1、TNFRSF1A)介导MAPK信号通路,影响MAPK活性和p-MAPK活性,调控MAPK失活。结论:基于生物信息学筛选出的TC差异Empagliflozin分子量PFRGs CD44、ANXA1和NR4A1与TC患者生存和预后相关,由3个基因构建的预测模型具有较好的预测能力,其作用机制可能与多基因网状调控MAPK信号通路有关。
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环状RNA KIF4A在结直肠癌中表达与功能及其作用机制
背景与目的:环状RNA KIF4A (circKIF4A)被发现在多种肿瘤的恶性进展中起到重要作用,然而,circKIF4A在结直肠癌中的生物学作用尚未见报道。因此,本研究late T cell-mediated rejection探讨circKIF4A对结直肠癌生物学行为的影响及机制FUT-175半抑制浓度。方法:用qRT-PCR检测不同结直肠癌细胞系与结肠黏膜上皮细胞以及结直肠癌组织与癌旁正常组织中circKIF4A的表达;用siRNA敲低结直肠癌SW620细胞中circKIF4A的表达后,分别检测细胞生长、克隆形成及侵袭能力以及细胞内总谷胱甘肽(T-GSH)/氧化型谷胱甘肽(GSSG)比例与铁死亡抑制蛋白SLC7A11表达的变化;通过生物信息学软件和双荧光素酶报告基因实验预测和分析circKIF4A的目标microRNA (miRNA)以及下游的靶基因并验证。结果:与正常结直肠上皮细胞及癌旁组织比较,circKIF4A在不同直肠癌细胞系及癌组织中的表达均明显上调(均P<0.05);敲低circKIF4A后,SW620细胞的生长、克隆形成Belumosudil采购、侵袭能力、细胞内T-GSH/GSSG比例及SLC7A11蛋白表达均明显降低(均P<0.05);预测与分析结果显示,circKIF4A序列上存在miR-515-5p结合位点,SLC7A11是miR-515-5p的下游靶基因;验证结果显示,在不同处理中,过表达miR-515-5p同时抑制circKIF4A对SW620细胞SLC7A11蛋白的表达的抑制最为明显(P<0.05)。结论:circKIF4A在结直肠癌细胞中表达升高,circKIF4A能促进结直肠癌细胞的生长与侵袭,其机制可能与circKIF4A-miR-515-5p-SLC7A11轴介导的铁死亡有关。
血清肝素结合表皮生长因子mRNA与急性冠脉综合征的关系
目的 观察分析血清肝素结GSKJ4体内实验剂量合表皮生长因子(HB-EGF)信使核糖核酸(mRNA)与急性冠脉综合征(ACS)的关系,探讨血清HB-EGF mRNA对ACS发病的预测价值及发病早期的诊断价值。方法 收更多集青海省人民医院急诊科2019年12月至2022年3月收治的经冠脉造影(CAG)确诊为ACS患者113例,分为急性心肌梗死(AMI)组58例和不稳定型心绞痛(UA)组55例,以同期在门急诊或体检时经CAG或冠脉CT检查无狭窄并有含高血压、糖尿病或吸烟的人群51例为对照组。采用实时荧光定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测ACS患者血清HB-EGF mRNA的表达水平。运用多元有序Logistic回归分析HB-EGF mRNA与ACS的关系。根据Gensini不同评分将ACS患者分为低分组(n=34)、中分组(n=56)和高分组(n=23),比较三组患者血清HB-EGF mRNA水平,并分析两组ACS患者血清HB-EGF mRNA与冠脉病变程度之间的相关性。应用ROC曲线下面积faecal immunochemical test(AUC)评估血清HB-EGF mRNA对ACS患者的诊断价值。结果 多元有序Logistic回归分析显示,HB-EGF mRNA是ACS的危险因素(OR=10.994, 95%CI4.005~30.182,P<0.001)。血清HB-EGF mRNA水平低分组<中分组<高分组(P<0.05)。UA组(r_s=0.667,P<0.001)和AMI组(r_s=0.857,P<0.001)血清HB-EGF mRNA与冠脉病变程度呈正相关。UA组和AMI组血清HB-EGF mRNA的AUC分别为0.911和0.979(P值均<0.001),以约登指数最大值所对应的值为最佳截断值,得到最佳工作点(optimal operating point, OOP)分别为1.68和2.14。结论 血清HB-EGF mRNA升高与ACS有关,HB-EGF mRNA在动脉粥样硬化的发生、发展中可作为一个独立的危险因子。
地黄苯乙醇苷成分生物合成的分子调控机制研究
为了研究地黄苯乙醇苷类成分生物合成的调控机制,对地黄全长转录组进行了测序,鉴定出参与苯乙醇苷类成分合成的MS-275试剂催化酶基因的序列,分析了催化酶基因的表达特性及其与毛蕊花糖苷合成的相关性。应用水杨酸(SA)及低温处理研究非生物诱导对地黄苯乙醇苷含量的影响和相关基因转录特性,测定了水杨酸和低温处理后地黄的生理生化指标变化、药效成分含量变化,并应用转录组测序技术分析了相关基因的表达模式。利用过量表达和基因编辑技术初步分析了RgWRKY35在地黄苯乙醇苷合成中的调控功能。主要研究内容如下:1.以地黄的叶、茎和块根为材料,利用Pacific Biosciences RS II平台进行全长转录组测序。共获得非冗余的转录本27 773条,平均长度2 380 bp,预测出27 236个CDS。利用BLAST等软件在NR、NT、GO、COG、KEGG、Swissprot和Interpro等数据库共预测到27399个注释的基因。NR注释表明,与地黄转录本匹配数量最多的是芝麻,有81.44%。推测了参与异毛蕊花糖苷、松果菊苷、肉苁蓉苷A、肉苁蓉苷F、2-乙酰毛蕊花糖苷和Leonoside F生物合成的催化酶,并鉴定出143个参与苯乙醇苷类成分生物合成的转录本。19个催化酶基因在地黄12个组织中与毛蕊花糖苷的含量呈正相关,embryonic culture media其中多数基因在叶和花中具有较高的表达量。2.以地黄栽培品种温85-5为材料,用SA喷施生长180 d的地黄植株,在处理后的0h、1 h、3 h和6 h收集地黄叶片和块根,测定毛蕊花糖苷及总苯乙醇苷的含量,并对SA处理后不同时间的块根进行转录组测序分析。结果显示,SA处理后地黄叶片中的毛蕊花糖苷提高了11.2~19.3%,块根中毛蕊花糖苷的含量提高了0.9~1.4倍。叶片中的总苯乙醇苷含量在SA处理后6 h比对照提高28.5%,块根中总苯乙醇苷含量在处理后分别比对照提高了0.65~0.82倍。转录组分析表明,苯乙醇苷生物合成通路在差异表达的基因中得到显著富Empagliflozin molecular weight集,ALDH基因、UGT基因和PPO等少数毛蕊花糖苷合成途径的催化酶基因在SA处理后的地黄块根中上调表达。筛选并鉴定出多个在SA处理后差异表达的AP2-EREBP、WRKY和MYB转录因子基因。3.利用人工智能气候箱对地黄品种QH-1和BZY进行不同温度处理,在5°C和15°C处理下地黄叶片中的抗氧化酶活性呈先升高后下降的趋势,脯氨酸含量先上升后降低,可溶性糖含量整体上呈上升趋势。测定了不同温度处理后地黄有效成分含量的变化,结果表明,适度低温促进总苯乙醇苷和毛蕊花糖苷含量的积累。对低温胁迫的地黄叶片进行转录组测序,结果显示低温胁迫后差异表达的基因主要富集在淀粉与蔗糖代谢、单萜生物合成、吲哚生物碱生物合成、类胡萝卜素生物合成、类黄酮生物合成等代谢通路。分析了低温处理后富集到苯乙醇苷生物合成通路的催化酶基因表达特性,筛选了响应低温参与苯乙醇苷和梓醇合成的候选基因,分析了低温处理后类黄酮生物合成途径差异表达的基因。4.利用聚合酶链式反应技术(PCR)克隆了地黄RgWRKY35基因,其编码区序列(CDS)长度894 bp,编码297个氨基酸。多序列联配表明RgWRKY35具有典型的WRKY结构域。亚细胞定位分析发现RgWRKY35蛋白分布在细胞核中,属于核蛋白。利用农杆菌介导法将RgWRKY35基因的过量表达载体和基因编辑载体导入地黄基因组,获得了过量表达和基因编辑的转化地黄植株。过量表达RgWRKY35基因的地黄株系毛蕊花糖苷含量显著升高,基因编辑RgWRKY35的地黄株系毛蕊花糖苷含量显著降低,表明RgWRKY35基因是地黄苯乙醇苷类成分毛蕊花糖苷的正向调控因子。
金刚烷胺通过诱导凋亡与自噬抑制胶质瘤生长的机制研究
目的:胶质瘤(Glioma)是常见的原发性神经系统恶性肿瘤,其治疗效果不佳,急需一种新的治疗策略。金刚烷胺(Amantadine,AMT)作为一种抗病毒和治疗帕金森病的临床用药,最近发现其具有抑制肿瘤生长的作用。该研究主要探索金刚烷胺对胶质瘤细胞生长和增殖的影响,验证金刚烷胺在体内和体外对胶质瘤的抑制作用,探讨金刚烷胺如何影响细胞凋亡和自噬,并研究其分子机制。方法:1.按照设定的金刚烷胺浓度梯度,处理U87和U251胶质瘤细胞,通过CCK-8试验、克隆形成实验、Ed U实验及乳酸脱氢酶(LDH)释放实验检测金刚烷胺对胶质瘤细胞活力及增殖的影响。2.通过免疫印迹、流式细胞术、活性氧(Reactive oxygen species,ROS)测量及JC-1检测试剂盒等方法,检测金刚烷胺作用于胶质瘤细胞后,细胞内ROS含量与线粒体膜电位变化以及对细胞凋亡的影响;通过免疫印迹和免疫荧光MLN8237体外等实验,明确金刚烷胺对胶质瘤细胞自噬及自噬流的影响。3.构建裸鼠皮下移植瘤模型,金刚烷胺进行体内给药后,观察肿瘤标本,测量肿瘤重量与体积,通过PIN-FORMED (PIN) proteins苏木精-伊红(Hematoxylin-eosin,HE)染色观察肿瘤细胞形态与数量,通过免疫组化检测Ki67表达量,验证金刚烷胺在体内的抑瘤作用;测量荷瘤裸鼠体重并绘制曲线,取其心肝脾肺肾等重要内脏行HE染色检测金刚烷胺在体内的毒副作用。4.取肿瘤组织进行免疫印迹实验和免疫组化实验,检测Cleaved-caspase3和LC3 II的表达量,明确体内胶质瘤凋亡及自噬情况。结果:1.金刚烷胺在体外抑制胶质瘤U87细胞与U251细胞的活力与增殖,且呈药物浓度依赖性。2.金刚烷胺导致胶质瘤细胞内ROS的大量累积且引起线粒体损坏,进而通过激活Caspase蛋白家族级联反应致使凋亡发生;金刚烷胺增强胶质瘤细胞ATG5、ATG7及P62的表达,促进LC3 I向LC3 II的转化,诱导自噬起始的发生且阻断了自噬流。3.金刚烷胺在体内有良好的抗胶质瘤活性,且对其他组织没有www.selleck.cn/products/vx-661明显的不良反应。4.金刚烷胺在体内促进Cleaved-caspase3和LC3 II的高表达,进而诱导凋亡和自噬的发生。结论:金刚烷胺通过在体内外诱导细胞凋亡和细胞自噬,从而抑制胶质瘤的生长和增殖。
迷迭香酸缓解食物过敏的效应评价及机制研究
食物过敏是指机体摄入含有某种致敏成分的食物而引发的不良变态免疫反应。食物过敏反应症状复杂多样,可导致呼吸道、皮肤、胃肠道等多个系统受到损害,甚至引起过敏性休克,严重时会威胁人类生命健康。近年来食物过敏发生率急剧增加,已成为全球广泛关注的公共卫生问题。严格避免过敏原的摄入是预防食物过敏的重要手段。但食物过敏原分布广泛,且长期避免摄入过敏食物将严重影响敏感人群的饮食营养与生活质量。目前,主要应用一些抗过敏类药物治疗食物过敏,该类药物存在副作用大及易复发等缺点,因此挖掘无毒无副作用的缓解食物过敏的活性成分至关重要。植物是一类重要的食药同源资源,当前报道具有抗过敏活性的物质大部分存在于食药用植物中。迷迭香酸(Rosmarinic acid,RA)是一种含有多羟基的咖啡酸酯天然多酚类化合物,具有抑菌、抑炎、抗肿瘤和抗过敏等一系列生物学活性,是食药和化妆品行业备受青睐的原材料。本研究从细胞和动物水平探讨RA缓解食物过敏的效应及潜在机制,主要研究内容如下:(1)网络药理学靶点预测利用网络药理学方法筛选RA与食物过敏的关联靶点,预测RA缓解食物过敏的潜在途径和机制。筛选出RA缓解食物过敏的重要效应靶点ALB、IL-2、Syk、CCL5、NFKBIA和NFKB1,通过GO和KEGG富集可知,关联蛋白主要富集在FcεRI通路、肿瘤相关通路、Th细胞通路、B细胞通路、NF-κB通路等通路。在FcεRI通路上RA的重要靶点Btk、Grb2和Syk分别有可能通过调节钙离子的内流、MAPK通路和免疫细胞的调节发挥缓解食物过敏的作用。(2)肥大细胞脱颗粒效应评价在细胞水平,通过MTT筛选RA对RBL-2H3细胞的安全剂量,寻找更多建立肥大细胞脱颗粒模型,通过检测组胺、m MCP-1的释放、脱颗粒、钙离子内流和ROS浓度,评价RA对肥大细胞脱颗粒的影响。同时利用q PCR分析MAPK通路相关基因的表达探究RA抑制肥大细胞脱颗粒的分子通路。通过MTT的方法筛选出了RA的无毒性范围是0.625-20μM。在此浓度范围内,RBL-2H3细胞的脱颗粒模型效应评价和分子机制研究都表明RA能抑制肥大细胞脱颗粒;同时建立PCA模型,RA低、中、高剂量组的小鼠的蓝斑颜色、耳朵的肿胀程度,进一步说明RA具有缓解Ig E介导的Ⅰ型超敏反应的效应。(3)动物水平缓解食物过敏效应评价在动物水平,建立卵白蛋白(Ovalbumin,OVA)诱导的BALB/c小鼠食物过敏模型,对RA缓解食物过敏进行效应评价和机制研究。结果表明RA可以显著缓解O获悉更多VA致敏引起的小鼠过敏反应症状、腹泻、温度下降以及过敏反应介质(OVA s Ig E、组胺和m MCP-1)在血清水平的下降、上调免疫器官(脾脏、肝脏)炎症相关的抑炎因子和下调相关的促炎因子的表达,并通过对肠道菌群的调节和肝脏氧化应激的调节发挥缓解食物过敏的活性。(4)血清脂质组学分析基于高分辨质谱对小鼠的血清进行digital immunoassay非靶向脂质代谢分析,通过多元统计分析,筛选在30、90、270 mg/kg剂量组RA干预下,与OVA致敏模型组的小鼠相比的潜在差异脂质代谢物,并进行通路富集分析。分析结果表明正离子模式下筛选出25种潜在差异脂质代谢物,负离子模式下筛选出36种潜在差异脂质代谢物。将潜在差异脂质代谢物进行通路富集,食物过敏小鼠的血清脂质代谢影响的通路是甘油磷脂代谢通路和鞘脂代谢通路,该结果表明RA可以通过调节部分甘油磷脂类、鞘脂类和α-亚麻酸类化合物来改善食物过敏的脂质代谢紊乱。
血小板抗体产生的影响因素及临床输注效果的分析
目的 分析昆明医科大学第一附属医院937例患者的血小板抗体检测结果及其影响因素,探究血小板抗体对临床输注效果的影响,为血小板抗体检测的运用价值提供依据,确保血小板的输注更有效CP-456773使用方法、更安全。方法 2019年6月至2021年4月期间,从申请备血或输血的住院患者中随机收集937例患者的标本,并进行血小板抗体的检测,通过电子病历系统、LIS系统收集患者的一般临床资料。结果 BIOCERAMIC resonance(1)多次输血患者血小板抗体阳性率为13.23%,血小板抗体的阳性率和输血的次数有关;(2)血小板抗体检测阳性率女性高于男性(15.95%VS. 10.57%,P <0.05);(3)血小板抗体检测阳性率内科患者高于外科患者(16PCI-32765价格.31%VS. 3.88%,P <0.05),其中内科中血小板抗体检测阳性率排前3的科室分别是血液科、急诊科、ICU(19.07%VS. 18.42%VS.16.95%);(4)对于血液内科患者,化疗的次数、联合使用2类以上化疗药物、既往输注血小板的次数与血小板抗体的检出率显著相关(P <0.05);(5)血小板输注有效组与无效组的抗体阳性率在统计学上有差异(P <0.05);(6)血小板抗体中的HLA抗体在非溶血性发热反应中的检出率高达67.85%(19/28)。结论 (1)血小板抗体的产生与输血次数呈正相关,影响血小板抗体阳性率的因素包括:血小板输注次数、女性孕产史、化疗病人化疗次数、化疗药物使用情况;(2)血小板抗体检测在血小板输注无效的调查研究,血液系统疾病及化疗患者输血疗效评估、输血策略制定、非溶血性发热性输血不良反应的诊断方面具有良好的运用价值;(3)配合性地输注血小板,能使血小板输注更有效。
蓝光诱导视网膜色素上皮细胞铁死亡的机制研究
目的:探讨蓝光诱导人视网膜色素上皮(ARPE)细胞铁死亡的发生及可能机制FUT-175。方法:体外培养的ARPE-19细胞接受405nm蓝光50mW/cm~2辐照度照射不同时间,分为对照组、16.3J/cm~2组、32.6J/cm~2组和65.2J/cm~2组;将65.2J/cm~2组定为高能量蓝光照射组,进一步分为对照组、高能量蓝光照射组和高能量蓝光照射+铁死亡抑制剂组,CCK-8检测细胞活力,试剂盒检测细胞内谷胱甘肽(GSH)含量、二价铁离子浓度及丙二醛(MDA)含量,Western blot法检测细胞内GPX4和xCT蛋白相对表达量。结果:蓝光照射导致ARPE-19细胞活力下降呈剂量依赖性,高能量蓝光照射导致细胞内GSH含量下降,二价铁离子浓度和MDA含量上升(均P<0.05);加入铁死亡抑制剂可部分恢复蓝光照射组细胞活力和GSH含量,减少MDA含量,降低二价铁离子浓度(均P<0.05);蓝光照射组GPX4和xCT蛋白相对表达量显著下降,加入铁死亡抑制剂后蛋白表达量不同程度恢复selleck HPLC(P<0.05)。结论:蓝光照射可能通过影响xCT和GPX4相关抗氧化途径诱导RPE细胞铁死亡发atypical infection生。
无舌川西小黄菊的抗炎及促凝和抗凝活性的初步测试
目的:对怒族民间草药无舌川西小黄菊的总醇提取物和乙酸乙酯萃取部分进行抗炎、抗氧化及促/抗凝血活性体外活性测试,测定了其总黄酮含量,并对其精油成分进行分析。方法:以巨噬细胞RAW264.7为实验细胞株,通过检测NO浓度评估抗炎活性。通过血小板聚集实验评价诱导血小板聚集活性;通过体外凝Designer medecines血实验研究抗凝血活性。以紫外分光光度法KPT-330纯度测定其总黄酮含量,以DPPH法测定总黄酮的抗氧化活性。通过气相色谱-质谱联用技术分析其精油化学成分。结果:无舌川西小黄菊总醇提取物和乙酸乙酯萃取物均有显著的抗炎活性。但只显示微弱的抗凝血活性,没有显示出血小板聚集活性。其总黄酮含量较高,具有良好的自由基清除能力。从其精油中分离了37个Canagliflozin试剂组分,鉴定了其中30个。结论:为进一步合理开发和利用无舌川西小黄菊资源提供了数据支撑。
五味子酮通过调节AKT/GSK3信号通路改善2型糖尿病大鼠血糖的研究
目的 探讨五PEG300溶解度味子酮的降血糖作用及其可能的作用机制。方法 构建2型糖尿病(T2DM)大鼠模型,给予低、中、高剂量五味子酮灌胃处理后,评估其空腹血糖、K值与肝脏指数,并采用PAS染色检测肝组织的糖原含量。建立高糖(55 mmol·L~(-1))诱导的HepG2细胞模型,给予五味子酮或AKT抑制剂MK-22DNA Purification06干GDC-0068临床试验预后,分别采用NBDG法和比色法检测细胞的糖摄取和糖生成能力。采用Real-time PCR和Western blot法进一步检测T2DM大鼠肝组织和高糖诱导HepG2细胞中磷酸化AKT(p-AKT)和糖原合成酶(GSK3)的表达。结果与正常组相比,T2DM大鼠的空腹血糖和肝脏指数显著升高,胰岛素敏感性、糖原合成能力显著降低,高糖(55 mmol·L~(-1))诱导的HepG2细胞葡萄糖摄取显著减少、而生成显著增多。分子生物学实验结果显示,T2DM大鼠和高糖(55 mmol·L~(-1))诱导的HepG2细胞AKT的磷酸化水平显著下调,而GSK3的表达水平显著上调,给予五味子酮干预能够有效逆转上述改变,且该逆转作用可被AKT抑制剂MK-2206终止。结论 五味子酮是一种潜在的降血糖药物,其降糖作用机制可能与调节AKT/GSK3信号通路有关。