背景:铜在多种恶性肿瘤中血清总浓度升高,与肿瘤的发生和发展密切相关Religious bioethics。铜死亡作为一种新近被发现的细胞死亡机制,在多种肿瘤预后中扮演重要角色。生物学上将非编码RNA(non-coding RNA,nc RNA)分为两大类ABT-263配制,一类是小于200bp的小nc RNA,另一类是大于200 bp的长链非编码RNA(long non-coding RNA lnc RNA),后者可以通过对转录、转录后、表观遗传水平、染色质重塑及DNA甲基化的作用,来调节肿瘤的关键通路。本研究旨在探究铜死亡相关基因与lnc RNA及食管癌之间的关系,并建立一个食管癌铜死亡基因相关lnc RNA预后风险模型。方法:在本研究中,首先从癌症基因组图谱(BI 10773the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载了食管癌相关的转录组数据、临床数据及肿瘤突变数据。随后对食管癌相关数据和铜死亡基因进行回归(LASSO-COX)分析构建了一个食管癌铜死亡基因相关lnc RNA预后模型,并对其进行了验证。验证包括绘制受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic,ROC)及生存曲线,对研究数据进行主成分分析(principal components analysis,PCA),对高、低风险组患者无进展生存(progression free survival,PFS)差异进行生存分析。通过将预后模型与其他临床病例特征相结合构建了方便将预后模型运用于临床的列线图。随后分析了高、低风险组患者的差异表达基因,通过KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析和GO(Gene Ontology)富集分析探究了高、低风险组患者差异表达基因的富集情况。最后,探究基于预后模型的食管癌高低风险组的肿瘤突变负荷状况(molecular function,TMB)、免疫细胞浸润情况及潜在的治疗药物。结果:本研究预后模型的构建包含4个铜死亡基因相关lnc RNA,分别为UGDH-AS1、TMEM161B-AS1、ALMS1-IT1 and AC011773.1。后续的分析表明高风险组患者较低风险组患者有着更低的生存率,本研究所构建食管癌预后模型能够准确预测患者1-,3-,5-年生存率并且是食管癌独立预后因素。PCA显示高风险组和低风险组之间高度分化,食管癌患者被用于构建模型的铜死亡相关lnc RNAs有效地分为两组。结合其他临床病例特征及预后模型所构建的列线图在评估生存方面也表现了良好的性能。随后的GO富集分析显示,在生物学过程(biological process,BP)类别中,基因主要富集在肌肉系统过程、肌肉收缩和发育成熟。在细胞组分类别(cell component,CC),主要富集于细胞-细胞连接和收缩纤维。在分子功能类别中(molecular function,MF),富集于细胞外基质结构成分。在KEGG富集分析中,基因在肌肉系统过程、肌肉收缩和细胞成熟进程中富集。肿瘤突变负荷分析提示高风险组食管癌患者较低风险组有着更高的肿瘤突变负荷。在免疫细胞浸润方面,我们还发现II型干扰素反应、APC共抑制、APC共刺激、CCR和T细胞共刺激功能在高低风险组浸润存在显著差异,随后筛选出了一种潜在的食管癌治疗药物NSC-207895,这对于食管癌患者有潜在的治疗价值。结论:本研究构建了一个包含4个铜死亡基因相关的lnc RNA的食管癌预后模型,该模型能够提高食管癌患者整体生存预测准确性,在食管癌的免疫治疗方面也具有潜在价值。