树莓Ri PAL1基因克隆及生物信息学分析

苯丙氨酸解氨酶（Phenylalanineammonialyase,PAL）是苯丙烷类代谢的关键酶，能调节树莓中黄酮类的生物合成。为了深入研究树莓中Ri PAL1基因的功能与调控机制，以树莓果实为材料提取总RNA，然后合成c DNA第一链，最后成功克隆出树莓果实Ri PAL1基因，并对其进行了相关的生物信息学分析。结果表明，Ri PAL1基因的编码序列（Codingsequence,CDS）全长为2 133 bp，编码710个氨基酸，分子量为77.50 ku，等电点为6.21。Ri PAL1蛋白疏水性最大值为4.50，Elexacaftor NMR最小值为-4.50，平均疏水指数为-0.49，为亲水性蛋白，无跨膜结构，无信Immunochemicals号肽。含有4个N糖基化位点和67个特异性激酶位点，二级结构以α螺旋为主，三级结构为同型四聚体。多序列此网站比对显示Ri PAL1蛋白具有典型的苯丙氨酸解氨酶保守结构域，系统进化分析表明Ri PAL1蛋白与同科植物草莓亲缘关系最近。本研究可为深入研究Ri PAL1基因参与树莓果实黄酮类物质生物合成的分子机制提供参考。