为了解阿坝中蜂此网站遗传多样性，对21个样点的347群阿坝中蜂样本进行线粒体DNA tRNPorta hepatisA~(leu)-COⅡ序列扩增、测序，获得347条长度为335bp多序列片段包括36bp的非编码序列和299bp的COII基因编码序列，两个NSC 127716序列A+T碱基含量分别是99.8%、84.6%，分析出14个碱基变异位点，占总测定位点4.18%；划分出18个单倍型（Hap＿1～Hap＿18），单倍型Hap＿1在所有样点均有分布且数量最多，有231个样本，达到总样本的66.6%。总体单倍型多样度为0.536，核苷酸多样度为0.00200，平均核苷酸差异数0.666，汶川县威州镇万村样本单倍体多样度最低，黑水县芦花镇昌德村样本单倍体多样度最高；单倍型系统发育树构建显示18个单倍型聚为2个大类群，不存在单独聚类一起单倍型；说明阿坝中蜂种群内部存在不同程度分化，研究结果可为阿坝中蜂遗传多样性研究、保护与利用提供一定的理论基础。